محمد موسوی در ۱۲ اردیبهشت ۱۳۲۵ در شهر اهواز بدنیا آمد. در کودکی علاقه زیادی به شنیدن موسیقی داشت و در آن زمان رادیو تنها وسیله‌ای بود که او می‌توانست در هر فرصتی پایش بشیند و به صدای ساز نوازندگان مورد علاقه اش گوش سپارد.

ابتدا به سازی دیگر علاقه داشت، اما با شنیدن صدای نی حسن کسائی از رادیو به شدت شیفته صدای نی شد. زمانی که اولین بار برای درس گرفتن نزد کسائی رفت، کسائی به وی گفت که بنوازد و وقتی موسوی نواخت، کسائی به او گفت: تو نیازی به آموزش نداری و می‌توانی خود کارت را با گوش دادن به رادیو دنبال کنی. در سال ۱۳۴۶ توسط احمد عبادی به رادیو راه یافت و در سال ۱۳۵۰ در مرکز حفظ و اشاعه موسیقی به فعالیت مشغول شد.

وی در گروه اساتید به همراهی فرامرز پایور، جلیل شهناز، علی‌اصغر بهاری و محمد اسماعیلی عضویت داشت و به همراه این گروه اجراهایی در ایران و سایر کشورها داشت. همچنین وی در آثاری مانند نوا و سر عشق با محمدرضا شجریان همکاری کرده‌است. موسوی به غیر از استادی نی، در نواختن سازهای سه تار و ویولن نیز تبحر بسیار بالایی دارد